Испытания самолета на предмет совместимости с ПКР AGM-84 «Гарпун» проводились в 1982 г. в испытательном центре авиации ВМС США Чайна Лэйк. Испытания прошли успешно и Австралия закупила партию ракет AGM-84A блок 1С, а затем более совершенных AGM-84D.
С середины 80-х годов летчики австралийских F-111 стали практиковать полеты с подвешенными для самообороны УР «Сайдуиндер». На вооруженных ракетами воздух-воздух «муравьедов» в качестве дополнительной возлагалась задача перехвата маломаневренных воздушных целей за пределами радиуса действия истребителей «Хорнет» и «Мираж» III.
Любимый аттракцион пилотов австралийских F-111 на авиационных праздниках - слив топлива в горячую струю выхлопа
Предпринимались попытки вооружить F-111С противорадиолокационными ракетами AGM-88 HARM, но по экономическим причинам «Уайлд Уизл» у австралийцев так и не появился.
В начале 90-х годов на австралийских F-111 полностью заменили аналоговое БРЭО цифровым. Модернизацию проводила американская фирма Рокуэлл Интернэшнл. «Ахиллесовой пятой» австралийских рейдеров является отсутствие современного бортового комплекса обороны, что не позволяет в настоящее время использовать F-111C для прорыва серьезной ПВО.
Эскадрильи RAAF получили ударные самолеты в «чистом» виде, в то время как согласно изначальным требованиям нужны были еще и разведчики. Программу разработки и производства RF-111 в Штатах аннулировали в 1970 г. В декабре 1974 г. австралийцы предложили фирме Дженерал Дайнемикс на основе RF-111A сделать RF-111C. Прототип выполнил первый полет с аэродрома Форт-Уорт в декабре 1978 г. Через три месяца этот самолет приземлился в Эмберли. Разведывательное оборудование размещалось в отсеке вооружения и включало две видеокамеры, инфракрасный сканер, две панорамные фотокамеры (одна для малых высот, вторая — для больших) и две фотокамеры обычного типа. В 1980 г. четыре самолета RF-111C поступили на вооружение разведывательного звена 6-й эскадрильи. В 1992 г. самолеты передали в 1-ю эскадрилью.
ВВС Австралии в летных происшествиях потеряли четыре самолета F-111С, в том числе - два в ходе визита в Новую Зеландию. Первый самолет разбился в апреле 1977 г. Данные о потерях весьма противоречивы. Так, согласно журналу «Интернэшнл Эйр Пауэр» первый F-111 австралийцы потеряли в апреле 1977 г., еще три самолета по разным причинам пришлось списать к 1980 г. В то же время в «Эйр Интернешнл» приводятся сведения о катастрофе в Новой Зеландии. Как бы то ни было, но часть самолетов навсегда вышла из строя, им требовалась замена.
Подписанный в 1963 г. контракт предусматривал поставку из США дополнительного количества F-111C по фиксированной цене, цене 1963 г. В 1980 г. встал вопрос о восполнении потерь. Фирма Дженерал Дайнемикс предложила австралийцам десять самолетов раннего выпуска, конкретно - предсерийные машины. Эти F-111 имели массу отличий от австралийских F-111C. В конечном итоге договорились о поставках четырех F-111A, отобранных из строевого подразделения ВВС США — 366-го тактического истребительного авиакрыла. Самолеты прибыли в Эмберли в мае, июле и августе 1982 г. Они поступили на вооружение 6-й эскадрильи RAAF. Позже самолеты модернизировали, максимально приблизив к «австралийскому» стандарту: установили крыло большего размаха и более прочные опоры шасси. После доработки самолеты стали официально именоваться F-111А[С], в просторечии - F-111С.
Прочность крыла стала постоянной головной болью австралийцев, так или иначе связанных с эксплуатацией F-111. Дело даже не в конструкционных пороках. В ВВС США F-111 отводилась роль «прерывателей ПВО», самолеты должны были совершать полеты со сложенным крылом на большой скорости. В ВВС Австралии F-111 большую часть полетного времени «парили» с расправленными крыльями или же с крыльями, установленными на умеренный угол стреловидности. Нагрузки, особенно изгибающие, на крыло в этом случае резко возрастали, а значит - снижался ресурс. Заклейка трещин на F-111 стала рутинной работой. В середине 80-х годов критики F-111 вновь подняли голову. Даже официальные лица министерства обороны Австралии стали поговаривать о .необходимости снятия самолетов с вооружения - слишком много оттягивают на себя денег. В то же время мнение ВВС в отношении «муравьедов» изменилось кардинально — штабу RAAF очень не хотелось терять «длинные руки». Лучшим средством убеждения военные сочли демонстрацию возможностей самолета, демонстрацию отчасти провокационную. Оснащенный контейнером «Пэйв Тэк» самолет взлетел с авиабазы Эмберли и взял курс на Канберру. Самолет облетел здание министерства обороны, а через пару часов чиновники местного Пентагона получили видеозапись своих кабинетов, сделанную с F-111 через оконные стекла. Эффект получился потрясающий! Тем более что представители ВВС намекнули, что вообще-то они показали не разведку, а нанесение точечного удара. Критика самолета сошла на нет.
В октябре 1992 г. министр обороны Роберт Бэй объявил о наращивании парка самолетов F-111 в составе RAAF путем закупки в США снятых с вооружения 27-го тактического истребительного авиакрыла USAF 8 самолетов F-111G. Модификация «G» была выбрана по причине наибольшей общности с F-111С (крыло, шасси, бортовая электроника). Перед поставкой самолетов в Австралию, они прошли в Штатах модернизацию, которая коснулась в основном бортового электронного оборудования. Сделка едва не сорвалась по причине резкого протеста со стороны извечного соперника Австралии Индонезии. Посол Индонезии в Канберре заявил официальный протест, в котором говорилось об изменении стратегической ситуации в регионе после получения Австралией дополнительного количества F-111. Не первый и не последний раз F-111 осложнил и без того не простые отношения между двумя государствами Тихого океана.
Пятнадцать самолетов прибыли в Эмберли в 1993-1994 г. г. Интересный факт: первый F-111G посадил в Эмберли командир эскадрильи Ричард Оуэн, сын штурмана самого первого совершившего посадку на этой же базе F-111С. Самолеты эксплуатировались на ротационной основе, часть поддерживалась в пригодном к полетам состоянии, часть - находилась на хранении. Один F-111G был потерян в 1999 г., два самолета используются как источники запасных частей.