В одном из вылетов на разведку ведомым Савицкого летал лейтенант Михаил Пивоваров. Западнее Вильнюса, где части 3-го гвардейского механизированного корпуса вели ожесточенные бои в тылу, наши истребители подверглись атаке 12 Fw-190. Пришлось принять неравный бой на малой высоте. Летчикам удалось не только выкрутиться, но и повредить несколько вражеских машин. Правда, после посадки на самолете Пивоварова насчитали восемнадцать пробоин, а в плоскости «Яка» командира корпуса зияла огромная дырища.
Каунасская наступательная операция началась 28 июля. К этому времени полк перелетел на аэродром Кармелава. Активность вражеской авиации резко повысилась, особенно против наступающих войск на переправах на Немане. Штурмовыми ударами по аэродромам противника и непрерывным патрулированием переправ удалось резко снизить эффективность немецкой авиации. Пытаясь не допустить Красную Армию к границам Восточной Пруссии, противник предпринял контрудар по войскам 1-го Белорусского фронта в районе Шауляя. На этом направлении были сосредоточены отборные авиационные части люфтваффе, благодаря чему немцы временно захватили инициативу в воздухе.
Воздушная разведка обнаружила полевой аэродром противника у населенного пункта Немокшты, на нем находилось свыше четырех десятков самолетов Fw-190 и Bf. 109. 16 августа двенадцать самолетов во главе с майором Анатолием Рубахиным нанесли по аэродрому штурмовой удар. Вслед за ними еще четыре налета совершили летчики остальных полков 265-й авиадивизии. На следующий день еще одна группа из десяти самолетов (ведущий капитан Михаил Пивоваров) провела штурмовку аэродрома. В итоге День Воздушного Флота (18 августа) прошел при резко снизившейся активности авиации противника. На следующий день полк получил задачу прикрывать действия штурмовых авиадивизий, наносивших удары по войскам противника, прорвавшего западнее Шауляя нашу оборону. Новым местом базирования стал аэродром Буда.
Из исторического формуляра полка: «22.6-1.9.1944 г., 3-й Белорусский фронт. Полк произвел 1361 боевой самолетовылет. Провел 70 воздушных боев, сбито 50 самолетов противника (13 Me-190, 33 ФВ-190, 1 Ю-87, 1 Савойя, 1 ФВ-156). При штурмовке уничтожено 39 самолетов противника. За образцовое выполнение заданий командования в боях с немецкими захватчиками при форсировании реки Березина, за овладение городом Борисов и проявленные при этом доблесть и мужество Указом Президиума Верховного Совета СССР от 10 июля 1944 г. полк награжден орденом Красного Знамени».
1 сентября 1944 г. полк под командованием майора Рубахина в составе 40 летчиков убыл в Багай-Барановку для получения истребителей Як-3 и переучивания летного состава на базе 8-го запасного иап. Переучивание заняло всего несколько дней — с 6 по 9 сентября. Общий налет за время переучивания составил 267 ч 45 минут, было выполнено 620 полетов, в том числе 414 полетов с налетом 267 ч 45 минут на Як-3.
В конце сентября личный состав полка вылетел на аэродром Могильно в 6 км северо-восточнее Владимир-Волынского. Летный состав отправили во Владимир-Волынский в дом отдыха для восстановления здоровья и подготовки к дальнейшим боевым действиям. Полк базировался в Могильно с 1 октября по 30 ноября 1944 г. Личный состав не только отдыхал, но и занимался боевой подготовкой. Было выполнено 652 полета с налетом 338 ч 40 минут. Выполнялись стрельбы по воздушным и наземным целям, отрабатывались индивидуальные и групповые воздушные бои, в том числе звено против звена, восьмерка против звена. 12 летчиков подготовили к полетам в сложных метеоусловиях.
15 октября генерал-лейтенант авиации Савицкий организовал показательный учебный бой между американской «Аэрокоброй», немецким Fw-190 и нашим Як-3. Хотя все истребители пилотировали опытные летчики, «Як» всеми наблюдавшими за поединком был признан победителем. В конце октября по содержанию материальной части и готовности к боевой деятельности полк занял первое место на корпусном смотре, а 3-й иак стал лидером аналогичного смотра в воздушной армии. Началась усиленная подготовка к перебазированию на фронтовой аэродром.
17 ноября 1944 г. под командованием майора Анатолия Рубахина полк в составе 45 летчиков и 48 самолетов Як-3 и Як-9 вошел в состав 16-й воздушной армии 1-го Белорусского фронта. Местом базирования стал польский аэродром Вышницы. Первой боевой задачей явилось прикрытие Магнушевского плацдарма на западном берегу Вислы, южнее Варшавы.
С наступлением морозов на Як-3 начала отклеиваться и отставать фанерная обшивка плоскостей — заводской брак. В соседнем 812-м полку во время тренировочного полета у самолета отлетела правая плоскость, летчик погиб. Для расследования причин катастрофы прибыла группа из ОКБ А.Яковлева. Во время их работы у лейтенанта Ивана Кружалина на самолете разрушилась левая плоскость, самолет сорвался в штопор, летчик погиб. Дальнейшие полеты на Як-3 запретили. Полк фактически оказался небоеспособным. Пришлось в полевых условиях в течение месяца с помощью представителей авиапромышленности устранять брак. Обшивка крыла снималась, обрабатывалась ацетоном и после просушки наклеивалась вновь, затем самолеты красили. От ядовитых жидкостей начались болезни: кашель, насморк, пятна по всему телу, язвы на руках, расстройство желудка. У многих, принимавших участие в ремонте самолетов, осталась стойкая аллергия на «химию» — различные растворители и краски. Тем не менее к Новому году удалось восстановить до пригодного к полетам состояния все самолеты полка.
В центре генерал-майор Е.Я. Савицкий, 1945 г.
4 января 1945 г.полк перебазировался на аэродром Желехув, ближе к Мангушевскому плацдарму. Из-за плохой погоды перелет проводился небольшими группами на высоте 150—200 м в условиях полного радиомолчания. Одна эскадрилья произвела посадку на передовой аэродром Мангушев. Была поставлена задача — прикрыть наземные войска на Мангушевском плацдарме, не допустить нанесения ударов немецкой авиации по переправам и вести непрерывную воздушную разведку. 8 января часть самолетов перелетела на аэродром Ласкажев.