При эксплуатации самолёта с корабля на кресло устанавливался механизм для отклонения траектории полёта кресла влево при катапультировании. Это сделано, чтобы исключить вероятность столкновения с надстройками, расположенными по правому борту. При перелётах с корабля на береговой аэродром посадку рекомендовалось производить по-самолётному, так как при катапультировании с левым креном и с подключённым механизмом безопасная высота покидания самолёта увеличивалась.
Система аварийного сброса откидной части фонаря - электромеханическая. Аварийный сброс обеспечивался только при закрытой верхней створке ПД. Сброс фонаря мог производиться как от приводов катапульты кресла, так и от кнопки "Авар. сброс фонаря" на правом борту кабины. На вертикальных и переходных режимах, когда верхняя створка ПД находилась в открытом положении, катапультирование производилось через остекление фонаря толщиной 8 мм, которое разрушалось пробойниками, установленными на заголовнике кресла. Чтобы разрушить остекление фонаря, при заклинивании его отъёмной части в подфонарной раме, при аварийном покидании самолёта на земле без катапультирования кресла, предназначалась система аварийного отстрела заголовника. На заголовнике имелось гнездо с шариковым замком для ручки его аварийного отстрела ( ручка размещалась на вертикальной стенке правого пульта кабины).
Как при автоматическом, так и при ручном катапультировании электросхема катапультной установки обеспечивала одновременную подачу напряжения от системы СК-ЭМ на включение ряда электромеханизмов: притяга и фиксации лётчика в кресле (аварийный притяг плеч и пояса, подъём ног, фиксация рук ограничителями разброса); механизма опускания светофильтра защитного шлема ЗШ-5А; "переброс" сопла порохового двигателя.
Для обеспечения безопасного катапультирования при неподвижной позе установлен механизм сброса левой руки с РУД-а. В соответствии с инструкцией вертикальные и переходные режимы полёта лётчики должны были выполнять с притянутыми и зафиксированными эксплуатационной системой плечами и поясом.
К дополнительным средствам обеспечения и спасения относились парашют ПСУ-36 серии с ИПС, высотный морской спасательный костюм ВМСК-4; облегчённый носимый аварийный запас и др.
Взлет по тревоге с палубы ТАКР
Авиагруппа на борту ТАКР "Киев"
В апреле 1978 г. произошло автоматическое катапультирование лётчика В.А. Казанцева при выполнении вертикальной посадки. Катапульта сработала автоматически по достижении самолётом параметров настройки системы СК-ЭМ "на пикирование". Катапультирование произошло практически с уровня земли (высота висения 1 м) после удара носовой частью самолёта о ВПП. Перед срабатыванием катапульты самолёт совершал колебательные движения с нарастающей амплитудой в диапазоне углов тангажа от плюс 27 до минус 17 град. с угловыми скоростями до 50 град. и ударами носовой и хвостовой частью о ВПП. Катапультирование произошло через остекление фонаря, траектория отстрела была близкой к вертикальной. Наполнение парашюта началось на высоте 70-80 м и закончилось на 20-25 м.
В состав пилотажно-навигационного, радио- и радиоэлектронного оборудования, установленного на самолёте Як-38, входили гироскопические приборы, предназначенные для определения углов крена и тангажа с выдачей их потребителям, обеспечивающие измерение курса в условиях базирования на корабле.
Для формирования курса в системе используется совместная работа курсовой гироплатформы с магнитным корректором. Магнитный корректор измеряет курс самолёта относительно магнитного или истинного меридиана и выдаёт его для коррекции сигналов курса, снимаемого с курсовертикали. Курс самолёта выставляется с помощью выносных устройств гироскопических устройств выставки курса (ГУВК), связанных с корабельным гирокомпасом.
Основная гидравлическая система самолёта обеспечивала питание гидроусилителей и управление складывающимися частями крыла. В качестве рабочего тела в основной бустерной системе использовалась жидкость АМГ-10. Система силовых приводов обеспечивала уборку и выпуск шасси, закрылков, открытие и закрытие створок ПД, заслонок забора воздуха в систему реактивного управления, открытие и закрытие заслонок поддува воздуха на раскрутку ПД или на передний струйный руль.