На одном из последних вариантов БМПТ установлены сразу две 30-мм автоматические пушки 2А42.	Левая автономная дистанционная установка автоматического гранатомета АГ-17Д.

30-мм автоматические пушки 2А42 имеют одиночный, малый (до 300 выстр./мин) и большой темп стрельбы (до 800 выстр./мин). Общий боекомплект составляет 900 выстрелов с бронебойно-трассирующими, осколочно-трассирующими и осколочно-фугасными трассирующими снарядами. В состав боекомплекта могут быть включены и выстрелы ЗУБР8 с бронебойно-подкалиберными снарядами. Питание пушек боеприпасами двухленточное, селективное, т.е. можно выбирать, какими снарядами вести огонь: или бронебойными (для поражения легкобронированных целей или живой силы за легкими укрытиями, например за кирпичной кладкой), или осколочными и осколочно-фугасными (для уничтожения живой силы, автомобильной и другой небронированной техники, самолетов, вертолетов и т.д.). Прицельная дальность огня из пушек БМПТ достигает 2000 м при стрельбе бронебойными снарядами и 4000 м при стрельбе осколочными и осколочно-фугасными снарядами. Кучность стрельбы при ведении огня из одной пушки такова, что рассеивание не превышает одной тысячной дальности: при стрельбе на максимальную дальность осколочными снарядами они будут падать друг от друга не более чем в четырех метрах. Если учесть, что радиус зоны сплошного осколочного поражения от одного снаряда составляет не менее 7 м, то можно с уверенностью сказать, что от одной короткой очереди из пяти снарядов (а из двух стволов это будет 10 снарядов) в радиусе 10 м от точки прицеливания ничего живого не останется. Эффект примерно такой же, как от разрыва 122-мм осколочно-фугасного снаряда.

Блок оружия стабилизирован в двух плоскостях, что обеспечивает высокую эффективность стрельбы как с места, так и с ходу.

Из всей российской бронетанковой техники БМПТ имеет самые высокие разведывательные возможности по обнаружению целей. Это достигается благодаря включению в состав комплекса вооружения машины современной автоматизированной системы управления огнем (СУО) «Рамка». В состав СУО входит комбинированный прицел наводчика, конструктивно объединяющий оптический, тепловизионный, лазерный дальномерный каналы и канал управления ракетой. Поле зрения прицела имеет независимую стабилизацию в двух плоскостях. Он обеспечивает обнаружение целей ночью, а также при плохих погодных условиях (снег, туман, дождь, пыль, дым) на дальностях не менее 3500 м. Командир машины располагает панорамным прицелом с оптическим, низкоуровневым телевизионным и лазерным дальномерным каналами. Поле зрения командирского прицела также имеет независимую стабилизацию в двух плоскостях. Прицел дает возможность вести командиру наблюдение и разведку целей на 360°, и для этого не обязательно поворачивать голову, достаточно лишь небольшого движения пальца руки. При необходимости командир может вывести изображение тепловизионного прицела наводчика на свое видеоустройство. В режиме «Дубль» он может вести эффективный огонь из основного оружия, спаренного пулемета и комплекса управляемого вооружения.

Ведение огня сразу из двух стволов.

Автоматизированная СУО с цифровым баллистическим вычислителем, комплектом автоматических датчиков условий стрельбы и автоматом сопровождения цели обеспечивает поражение обнаруженных неподвижных и движущихся целей как с места, так и с ходу с вероятностью, близкой к единице. При этом действия стреляющего сводятся к минимуму простых операций.

Пулемет ПКТМ предназначен для поражения живой силы противника и небронированной техники. Большой угол возвышения дает возможность ведения огня по высокорасположенным целям, что особенно важно при ведении боя в особых условиях. Боекомплект пулемета составляет 2000 патронов, снаряженных в одну ленту. Это исключает необходимость одному из членов экипажа тратить время на перезаряжание магазин-коробок с лентами и не отвлекает его от выполнения своих основных функций во время боя.

Для борьбы с более защищенными целями БМПТ оснащена ПТРК «Атака-Т» с дальностью стрельбы до 6 км. Комплекс включает четыре пусковые установки управляемых ракет, которые могут быть снаряжены кумулятивной тандемной или осколочно-фугасной (термобарической) боевой частью. Такой набор боевых частей управляемого вооружения позволяет БМПТ с высокой вероятностью поражать любые современные и перспективные основные боевые танки, сильно укрепленные долговременные огневые сооружения, низколетящие вертолеты и другие цели. Сверхзвуковая скорость полета ракеты в сочетании с полуавтоматической системой управления в информационном лазерном луче не оставляет шансов противнику принять какие-либо меры противодействия после ее пуска по цели. Ракета «Атака» с тандемной кумулятивной боевой частью способна пробить после динамической защиты танка броню толщиной 800 мм, а с термобарической боевой частью по своей эффективности сравнима с осколочно-фугасным снарядом 155-мм гаубицы. В стандартном варианте пусковые установки ПТРК заряжаются двумя ракетами с кумулятивной и двумя ракетами с осколочно-фугасной боевыми частями. Однако в зависимости от характера предстоящих боевых задач количество тех или иных типов ракет в боекомплекте машины может варьироваться.