В качестве дополнительного вооружения на БМПТ предусмотрены два дистанционно управляемых автоматических гранатомета АГ-17Д. Стрельбу из каждого из них ведет наводчик-оператор, поражая танкоопасную живую силу и небронированные цели в своих секторах, составляющих 6° в сторону продольной оси машины и 28° в сторону борта. Возможность ведения огня из автоматических гранатометов по навесной траектории позволяет поражать противника за естественными и искусственными укрытиями. Дальность стрельбы из автоматических гранатометов до 1700 м. Боекомплект составляет по 300 выстрелов на гранатомет, причем все выстрелы для каждого из них снаряжаются в одну ленту и не требуют перезаряжания магазин-коробок.
Основное оружие БМПТ расположено сверху на низкопрофильной башне, имеющей противоснарядное комбинированное бронирование.
Управление наведением гранатометов электрическое, производится при помощи кнюппеля, аналогичного органам управления комплексом вооружения с места командира на танке Т-90С. Для прицеливания оператор гранатометной установки использует комбинированный (дневной/ночной) прицел «Агат-МП» со стабилизированным полем зрения в вертикальной плоскости. Независимая стабилизация поля зрения прицела автоматических гранатометов обеспечивает высокую эффективность их огня при стрельбе с места и с ходу. С установкой двух независимых друг от друга автоматических гранатометов БМПТ впервые получила возможность ведения прицельного огня по трем различным целям сразу.
На БМПТ обеспечена всеракурсная защита от противотанковых средств.
Высокая защищенность БМПТ обеспечивается броневым корпусом, позаимствованным у танка Т-90С, и низким профилем башни. Все оружие вынесено за пределы боевого отделения. По сравнению с танком Т-90С защита БМПТ несколько усилена за счет оборудования лобовой части корпуса дополнительными броневыми плитами и новой встроенной динамической защитой. Бортовые экраны машины почти по всей длине оснащены элементами динамической защиты или специальными противокумулятивными решетками, что обеспечивает защиту бортовых и кормовой проекций БМПТ от гранат ручных противотанковых гранатометов и ПТУР. Для снижения вероятности поражения экипажа и жизненно важных систем и агрегатов машины осколками брони при ее пробитии (если вдруг такое все же произойдет) отделение управления и боевое отделение изнутри отделаны материалом типа «кевлар» в несколько слоев.
Машина оборудована ФВУ и быстродействующей системой обнаружения и тушения пожаров. Повышена и противоминная стойкость за счет усиления днища машины, установки пиллерсов и крепления сидений экипажа к верхним деталям корпуса. Предусмотрено также применение системы электромагнитной защиты, вызывающей нейтрализацию (преждевременный подрыв) противотанковых мин или фугасов с радио- и магнитометрическими взрывателями. А для преодоления минных полей с обычными минами нажимного действия и проделывания в них проходов на БМПТ могут навешиваться колейные ножевые минные тралы типа КМТ-6М2 или КМТ-8, а также катково-ножевой минный трал КМТ-7.
Учитывая увеличение на поле боя количества современных управляемых противотанковых средств, на БМПТ, как и на всех современных российских танках, установлена система постановки завес (СПЗ). Она предназначена для создания помех ПТУР, имеющим полуактивную лазерную головку самонаведения, работающую по отраженному от цели лазерному лучу (типа Maverick, Hellfire), ПТУР и артиллерийским корректируемым снарядам (типа Copperhead), которые используются с лазерными целеуказателями и дальномерами, а также для маскировки машины постановкой аэрозольной завесы.
