Сформировано в сентябре 1940 из финансового отдела как финансовое управление при Наркоме обороны.
В 1942 передано в состав тыла. Аналогичные изменения произведены во фронтах, округах и армиях.
По штату 01/228 от 18.5.42 состояло из отделов:
а также:
Численность - 377 человек (117+192) (где-то опечатка).
В сентябре 1943 переведено на штат 01/364 от 18.9.43 переименовано в Финансовое управление КА (тут же написано, что название изменено с 12.6.43). Численность управления 377 человек (125+252). Добавлены отдел специального финансирования и отделение по изучению и использованию опыта финансирования в Великой Отечественной войне.
Приказом НКО № 0377 от 23.11.44 передано в подчинение Заместителя Наркома обороны.
Численность в 1944-45 годах 416 человек (170+246).