Подводные лодки типа I-13 были лодками обычного типа, которые были срочно переоборудованы в подводные авианосцы. Противоминные наделки (були) в значительной мере увеличивали их ширину, что давало возможность устроить на них ангар, подобный ангару подводной лодки I-400, но вмещавший всего два самолета. Однако атака Панамского канала так и не состоялась Часть лодок этих типов приняли участие в операции по захвату американских островов Улити, имевшей место в последние недели войны.

С 1942 года японцы прекратили строительство подводных лодок типа "Kaidai". переключившись на постройку менее крупных лодок типа Ro-35, конструкция которых несколько напоминала лодки типов Ro-ЗЗ и Ro-34, вошедшие в строй в 1935-37 годах Эти лодки были аналогичны немецким типа U-IX, но с более упрощенной конструкцией. Они получили высокую оценку японских моряков, так как оказались очень маневренными и обладали хорошими мореходными качествами. Подводная лодка типа Ro-100, еще более меньших размеров и которую можно сравнить с немецкими лодками типа U-II и британскими типа V, была разработана для защиты воздушных баз. расположенных на островах Тихого океана. Лодки типа Ro-100 были еще более простой конструкции, чем предшественницы, что значительно облегчило их строительство. Срок их постройки составлял около двенадцати месяцев.

Следом за этим японцы начали строить лодки, подобные немецким U-XXI и U-XXIII. Это были лодки типов I-201 и На-201. Командующий японским подводным флотом адмирал Мива, ранее занимавший пост начальника управления строительства подводных лодок, заявил, что японские инженеры пришли к тем же выводам, что и немецкие своими собственными изысканиями, а не путем подражания последним. Это заявление выглядит вполне обоснованным, так как японцы еще в 1937 году включили в кораблестроительную программу одну опытную лодку Nr.71, которая должна была развивать под водой скорость хода в 25 узлов. Эта лодка в августе 1938 года в Куре была подготовлена к испытаниям и служила в течение своей непродолжительной жизни только как опытовое экспериментальное судно, однако вместо скорости 18-25 узлов была достигнута в надводном положении скорость в 13 узлов, а в подводном 20,5 узлов. Строительство этой лодки сохранялось в глубокой тайне. Подводные лодки типов I-201 и На-201 также имели скорость подводного хода большую чем надводного хода: 19 узлов против 13. Следовательно, лодки типа I-201 оказались более быстроходны, чем немецкие U-XXI. Кроме того, японские лодки имели "шнорхель", легкие дизели MAN, аккумуляторные батареи большой емкости, сварной корпус сильно вытянутой формы. Немецкие лодки превосходили японских собратьев в вооружении и дальности хода. Головной корабль японской серии был заложен на пять недель раньше чем первая немецкая лодка серии U-XXI.

Лодки типа На-201 были заложены только в начале 1945 года, когда над Японией нависла угроза американского вторжения. Головная лодка была построена в короткий срок - за три месяца и была полностью оснащена 31 мая 1945 года. Эти небольшие лодки обладали автономностью 15 суток Результаты испытаний оказались отличными. Оба типа лодок - I-201 и На-201 - строились секционным методом и собирались по частям на стапелях.

* Лодки типа I-201 имели подводную автономность по возможности движения 55 минут на скорости 19 узлов и 12 часов при 3-узловой скорости.

** Планировалось построить 90 лодок типа НА-201. Темпы строительства этого типа лодок по расчету были достаточно высоки - 13 лодок в месяц.